Археологический музей имеет двадцать галерей, заполненных артефактами со всей Турции и Востока, посвященных 5000-летней истории, с экспонатами из Восточной Римской империи, Османской империи и многих цивилизаций Анатолии и Древнего Египта. В главном здании хранятся находки археолога 19-го века Османа Хамди Бея, в частности знаменитый саркофаг Александра 4-го века, обнаруженный в королевском некрополе Сидона в Ливане. В Музее древнего Ближнего Востока хранятся артефакты из Египта и Месопотамии, в том числе великолепный фриз с изображением быка из Вавилонских ворот Иштар.
Музеи разделены зданиями и этажами, включающими Археологический музей, Музей Древнего Востока (Музей древних восточных артефактов) и Музей плиточных киосков.